Concrètement, la médiation animale est souvent utilisée sous forme d'ateliers ou de séances avec des objectifs définis.
Le zoothérapeute sélectionne les animaux médiateurs et les outils les plus pertinents pour poursuivre ces objectifs.
Une séance type se déroule en plusieurs séquences :
- un temps de retrouvailles, d'échanges et de présentation du déroulement de la séance
- des activités à partir d'outils supports variés pour travailler les fonctions cognitives, la motricité, l'approche sensorielle...
- des activités directement en lien avec les animaux (portage, brossage, récompenses, jeux cognitifs, parcours...)